С. Трубачев – педагог

Ещё во время своей учёбы Трубачев начинает работать в детской музыкальной школе г. Загорска – преподаёт историю и теорию музыки, сольфеджио. В начале 1950-х гг. работает в Московском музыкальном училище им. Октябрьской революции, а также руководит любительским хором Загорского оптико-механического завода. Ученики вспоминают его с благодарностью, говорят об очень высоком уровне эрудиции и преподавания молодого учителя. Трубачев полон творческими планами: обсуждает с М. Юдиной возможности создания Баховского оркестра, изучает труды Б. Яворского по символике христианской культуры.
В феврале 1951 г. Сергей прошёл дирижёрский отбор на Международный фестиваль молодёжи в Берлине для выступления с оркестром Московской консерватории. Но для выходца из семьи репрессированного священника поездка за рубеж была запрещена.
В середине 1950-х гг. по рекомендации М. Юдиной начинает работать в Петрозаводске – главным дирижёром Карельского радио и телевидения, преподаёт теорию в музыкальном училище, управляет вновь созданной хоровой капеллой. Для этого хора делает первые собственные обработки народных песен. В 1957 г. после успешного выступления капеллы в Декаде карельского искусства в Москве становится заслуженным деятелем искусств Карельской АССР

. Под управлением Трубачева исполняется «Реквием» Моцарта в исполнении Ленинградской хоровой капеллы и Петрозаводского симфонического оркестра. В 1956–1959 гг. Сергей Зосимович много работает над организацией Карельского хорового общества, становится его первым председателем. В концертах под управлением Трубачева выступают великие советские артисты – Г. Гинзбург, Я. Зак, Т. Николаева, С. Кнушевицкий, Э. Грач, А. Ведерников и др.
В Москву Трубачев возвращается в 1961 г. В этом же году возобновляет работу с любительским хором Загорска. В 1967 г. на Всесоюзном фестивале этот хор был отмечен дипломами.
В 1964–1971 гг. Сергей Зосимович преподаёт дирижирование в Московском государственном институте культуры. Работает он также на факультете народных инструментов в институте им. Гнесиных, где с 1967 г. возглавляет кафедру оркестрового дирижирования. Класс Трубачева закончили более 30 человек. Несколько раз в году Сергей Зосимович устраивает концерты с различными оркестрами (московскими и провинциальными).
Ученик (ныне – профессор) П. Б. Ландо вспоминает, что Трубачев «…был необычайно требовательный, твёрдый преподаватель и воспитывал … примером