В связи с организацией охранных зон государственного заповедника расположенным в этих зонах сельскохозяйственных предприятий и крестьянских фермерским хозяйствам было запрещено применение на полях минеральных удобрений и агрохимикатов и т

Да, требование о возмещении убытков в данной ситуации обоснованно.
Согласно ст. 1069 ГК РФ: Вред, причиненный гражданину или юридическому лицу в результате незаконных действий (бездействия) государственных органов, органов местного самоуправления либо должностных лиц этих органов, в том числе в результате издания не соответствующего закону или иному правовому акту акта государственного органа или органа местного самоуправления, подлежит возмещению. Вред возмещается за счет соответственно казны Российской Федерации, казны субъекта Российской Федерации или казны муниципального образования.
Необходимо отметить, что в п.3 ст. 1064 ГК РФ указано: Вред, причиненный правомерными действиями, подлежит возмещению в случаях, предусмотренных законом.
По условиям задачи действия местной администрации правомерны, в силу п . 4 ст. 95 ЗК РФ: Для предотвращения неблагоприятных антропогенных воздействий на государственные природные заповедники, национальные парки, природные парки и памятники природы на прилегающих к ним земельных участках и водных объектах создаются охранные зоны. В границах этих зон запрещается деятельность, оказывающая негативное воздействие на природные комплексы особо охраняемых природных территорий.
Поэтому согласно п.1 ст. 57 ЗК РФ: Возмещению в полном объеме, в том числе упущенная выгода, подлежат убытки, причиненные: 2) ухудшением качества земель в результате деятельности других лиц; 4) ограничением прав собственников земельных участков, землепользователей, землевладельцев и арендаторов земельных участков; 4.1) ограничением прав собственников расположенных на земельных участках зданий, сооружений, помещений в них, лиц, с которыми заключены договоры социального найма или договоры найма жилых помещений государственного или муниципального жилищного фонда в многоквартирных домах, в связи с установлением, изменением зон с особыми условиями использования территорий, режим которых не допускает размещение данных объектов; 5) изменением целевого назначения земельного участка на основании ходатайства органа государственной власти или органа местного самоуправления о переводе земельного участка из состава земель одной категории в другую без согласования с правообладателем земельного участка.
В п.2 ст