Во время нахождения морского судна приписанного к порту России

Действия капитана морского судна, абсолютно правомерны. Согласно ст.69 "Кодекса торгового мореплавания Российской Федерации":
1. На судне, находящемся в плавании, капитан судна возбуждает уголовное дело публичного обвинения и осуществляет неотложные следственные действия в соответствии с Уголовно-процессуальным кодексом Российской Федерации.
2. В случае возбуждения уголовного дела публичного обвинения порядок и особенности выполнения капитаном судна, в связи с этим действий, не относящихся к процессуальным, определяются федеральным органом исполнительной власти в области транспорта.
Согласно ст.40 УПК РФ ч.3, Возбуждение уголовного дела в порядке, установленном статьей 146 настоящего Кодекса, и выполнение неотложных следственных действий возлагаются также на: капитанов морских и речных судов, находящихся в дальнем плавании, - по уголовным делам о преступлениях, совершенных на данных судах . А именно капитан произвел неотложные следственные действия в соответствии с ч.1 ст.157 УПК РФ («при наличии признаков преступления, по которому производство предварительного следствия обязательно, орган дознания в порядке, установленном статьей 146 настоящего Кодекса, возбуждает уголовное дело и производит неотложные следственные действия»), п.6 ч.2 ст.157 УПК РФ («неотложные следственные действия производят иные должностные лица, которым предоставлены полномочия органов дознания в соответствии со статьей 40 настоящего Кодекса»).
Таким образом, капитан этого судна совершенно обоснованно возбудил уголовное дело по факту кражи. Также в полномочия капитана входят действия по проведению расследования по факту совершения преступления и составления обвинительного акта. В соответствии с ч.1 ст. 150 УПК РФ предварительное расследование производится в форме предварительного следствия либо в форме дознания