Орган законодательной власти субъекта РФ представил эксперту для заключения проект областного закона «О регулировании водных отношений на территории субъекта РФ…»

Нет, эксперт не прав. В соответствии с п. «в» ч.1 ст.72 Конституции РФ вопросы владения, пользования и распоряжения среди прочего водными ресурсами находятся в совместном ведении Российской Федерации и субьектов.
Также в силу ч.1 ст.2 Водного кодекса Российской Федерации водное законодательство состоит из настоящего Кодекса, других федеральных законов и принимаемых в соответствии с ними законов субъектов Российской Федерации.
Но как устанавливает ч.7 ст.2 Водного кодекса на основании и во исполнение настоящего Кодекса, других федеральных законов, иных нормативных правовых актов Российской Федерации, законов и иных нормативных правовых актов субъектов Российской Федерации органы местного самоуправления в пределах своих полномочий могут издавать нормативные правовые акты, регулирующие водные отношения.
Соответственно орган законодательной власти субъекта имеет права в своих законах устанавливать принципы водного законодательства, но они не должны противоречить федеральному законодательству.