На основании действующих нормативно-правовых актов

Министерство природных ресурсов и экологии Российской Федерации самостоятельно осуществляет правовое регулирование по следующим вопросам:
геологическое изучение, рациональное использование и охрана недр;
использование, охрана, защита лесного фонда и воспроизводство лесов;
использование и охрана водных объектов;
эксплуатация водохранилищ и водохозяйственных систем комплексного назначения, защитных и других гидротехнических сооружений (за исключением судоходных гидротехнических сооружений) и обеспечение их безопасности;
охрана, использование и воспроизводство объектов животного мира и среды их обитания;
особо охраняемые природные территории;
охрана окружающей среды и обеспечение экологической безопасности;
охрана атмосферного воздуха;
обращение с отходами производства и потребления (за исключением радиоактивных);
совершенствование экономического механизма регулирования природопользования и охраны окружающей среды.
В структуру входит:
Федеральная служба по гидрометеорологии и мониторингу окружающей среды (Росгидромет)
Федеральная служба по надзору в сфере природопользования (Росприроднадзор)
Федеральное агентство водных ресурсов (Росводресурсы)
Федеральное агентство по недропользованию (Роснедра)
Федеральное агентство лесного хозяйства (Рослесхоз)
Министерство осуществляет следующие функции:
по выработке государственной политики и нормативно-правовому регулированию в сфере агропромышленного комплекса, включая животноводство (в том числе разведение одомашненных видов и пород рыб, включённых в Государственный реестр охраняемых селекционных достижений), ветеринарию, обращение лекарственных средств для ветеринарного применения, растениеводство, карантин растений, мелиорацию земель, плодородие почв, регулирование рынка сельскохозяйственной продукции, сырья и продовольствия, пищевую и перерабатывающую промышленность, производство и оборот табачной продукции, устойчивое развитие сельских территорий;
по выработке государственной политики в сфере винодельческой, кондитерской, консервной, макаронной, масложировой, маслосыродельной, молочной, мукомольно-крупяной, мясной, пивоваренной, плодоовощной, птицеводческой, рыбной, сахарной, соляной, спиртовой, табачной, хлебопекарной промышленности и промышленности безалкогольных напитков;
по выработке и реализации государственной политики и нормативно-правовому регулированию в сфере земельных отношений (в части, касающейся земель сельскохозяйственного назначения), по государственному мониторингу таких земель;
по оказанию государственных услуг в сфере агропромышленного комплекса, включая устойчивое развитие сельских территорий;
по управлению государственным имуществом на подведомственных предприятиях и учреждениях.